Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms