Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms