Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed9Q99KF1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed9Q99KF1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms