Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfdQ925I7 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms