Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Nfatc1-201ENSMUST00000035800 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SptssbQ925E8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms