Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Thoc3Q8VE80 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 716.2 ms