Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Stx18Q8VDS8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Stx18Q8VDS8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Stx18Q8VDS8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms