Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms