Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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OptnQ8K3K8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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OptnQ8K3K8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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OptnQ8K3K8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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OptnQ8K3K8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OptnQ8K3K8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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