Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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