Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Lrrtm1Q8K377 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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