Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms