Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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