Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms