Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc27Q8CD92 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc27Q8CD92 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms