Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc15Q8C9M2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc15Q8C9M2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc15Q8C9M2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc15Q8C9M2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms