Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vwc2Q8C8N3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms