Protein–RNA interactions for Protein: Q8C196

Cps1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, mousemouse

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Length 1,500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cps1Q8C196 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cps1Q8C196 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cps1Q8C196 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cps1Q8C196 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cps1Q8C196 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cps1Q8C196 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cps1Q8C196 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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