Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l1Q8C0J2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l1Q8C0J2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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