Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnrQ8BYI9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TnrQ8BYI9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TnrQ8BYI9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnrQ8BYI9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnrQ8BYI9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TnrQ8BYI9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnrQ8BYI9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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