Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp47Q8BY87 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms