Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcaf1Q8BNE1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms