Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp1Q8BJQ2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms