Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms