Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms