Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms