Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms