Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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