Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt9Q6RHW0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms