Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttbk1Q6PCN3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms