Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp49Q6P9L4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp49Q6P9L4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp49Q6P9L4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Usp49Q6P9L4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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