Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm4Q6IRU2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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