Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cln3Q61124 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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