Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms