Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms