Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ecm2Q5FW85 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ecm2Q5FW85 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms