Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam220aQ3ZN08 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms