Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Kdm5aQ3UXZ9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms