Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms