Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms