Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec24aQ3U2P1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sec24aQ3U2P1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms