Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q3U1D9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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