Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms