Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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