Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf3c3Q3TMP1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf3c3Q3TMP1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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