Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp39Q3TIX9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms