Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cers3Q1A3B0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms