Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Traf3ip1Q149C2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Traf3ip1Q149C2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Traf3ip1Q149C2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Traf3ip1Q149C2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Traf3ip1Q149C2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Traf3ip1Q149C2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms