Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1150.7 ms