Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms